全球基因測序和芯片技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者因美納(納斯達克股票代碼：ILMN)宣布與deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、葛蘭素史克、強生和諾華公司合作，啟動一項試點蛋白質(zhì)組學(xué)項目，分析來自英國生物樣本庫(UK Biobank, UKB)的5萬份樣本。該試點項目基于因美納即將推出的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測方案Illumina Protein Prep™，由SOMAmer®技術(shù)提供支持，以新一代測序(NGS)解決方案助力科研界和制藥合作伙伴規(guī)�；@取蛋白質(zhì)組學(xué)洞見。
蛋白質(zhì)組學(xué)為直接觀測細胞功能提供了可能，從而幫助科研工作者深化對蛋白質(zhì)在健康與疾病中作用的理解，并有助于發(fā)現(xiàn)癌癥和心血管疾病等疾病的生物標志物。研究人員使用蛋白質(zhì)數(shù)量性狀位點(pQTLs)，這是一種將遺傳變異與蛋白質(zhì)表達數(shù)據(jù)和疾病或其他表型相聯(lián)系，用于藥物發(fā)現(xiàn)的重要蛋白質(zhì)基因組學(xué)工具。隨著Illumina Protein Prep等高通量蛋白質(zhì)組學(xué)方法的出現(xiàn)，新的pQTL的發(fā)現(xiàn)變得更加便捷。
"英國生物樣本庫的數(shù)據(jù)已經(jīng)成為組學(xué)領(lǐng)域的標準參考數(shù)據(jù)集，在Illumina Protein Prep推出之際，我們很高興能在這一試點研究中與醫(yī)療行業(yè)合作伙伴開展合作，" 因美納首席技術(shù)官Steve Barnard博士表示，"我們相信該試點項目將為科研界和制藥合作伙伴提供一套新的高質(zhì)量、基于NGS的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)，以促進生物學(xué)洞見的生成。"
英國生物樣本庫將提供5萬份樣本，這些樣本均來自已參與英國生物樣本庫制藥蛋白組學(xué)項目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)的研究對象，該項目是英國生物樣本庫與14家生物制藥公司之間的一項獨立研究合作。deCODE Genetics將利用Illumina Protein Prep解決方案和NovaSeq™ X Plus測序儀對樣本進行處理，并通過DRAGEN蛋白定量分析流程進行分析。首批3萬份樣本的研究由因美納、deCODE Genetics和Standard BioTools, Inc.聯(lián)合投資資助，Tecan作為自動化合作伙伴提供相應(yīng)的支持。這些樣本產(chǎn)生的數(shù)據(jù)將在2025年下半年完成質(zhì)量控制后由英國生物樣本庫立即提供給科研界。
對于另外的2萬份樣本產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，根據(jù)英國生物樣本庫的標準慣例，行業(yè)聯(lián)盟成員將擁有一段時間的獨家訪問權(quán)。行業(yè)參與者包括deCODE Genetics及制藥合作伙伴葛蘭素史克、強生和諾華。在此專屬期結(jié)束后，英國生物樣本庫將向更廣泛的科研界提供這些數(shù)據(jù)。因美納預(yù)計將有更多公司加入該聯(lián)盟。
英國生物樣本庫首席研究員兼首席執(zhí)行官Rory Collins爵士、教授表示："這些日益豐富的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)將幫助研究人員描繪出一幅更加動態(tài)的圖景，呈現(xiàn)個體遺傳、環(huán)境和生活方式如何共同影響不同疾病的發(fā)展。"
"這一項目補充了英國生物樣本庫制藥蛋白組學(xué)項目的工作，在原先項目基礎(chǔ)上提供了額外的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測數(shù)據(jù)。我很期待看到全球科學(xué)界如何利用這些不同來源的數(shù)據(jù)，在預(yù)防和治療多種疾病的新方法開發(fā)中取得突破性進展。"
"蛋白質(zhì)組學(xué)正在進入一個變革的時代，迄今為止，其在人類健康領(lǐng)域的影響受到傳統(tǒng)技術(shù)的限制，" Standard BioTools, Inc.首席執(zhí)行官Michael Egholm博士表示，"今天標志著一個重要的里程碑，因為我們將領(lǐng)先的、具備多種能力的由DNA驅(qū)動的SOMAmer技術(shù)與領(lǐng)先的NGS平臺無縫集成，進一步釋放英國生物樣本庫的潛力以加速人類健康的發(fā)展。"
檢測方法通過11K SOMAmer(慢解離速率修飾適配體)試劑檢測9,000種獨特的人類蛋白質(zhì)，實現(xiàn)從樣本到分析的蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)研究。這一解決方案已在早期試用中為客戶所用，能夠檢測6,000種人類蛋白質(zhì)，并與NovaSeq X、NovaSeq X Plus以及NovaSeq 6000測序儀兼容，從而在單一平臺上實現(xiàn)多組學(xué)研究。該解決方案計劃于2025年上半年正式推出。
